09 TRƯỜNG HỢP DOANH NGHIỆP CÓ THỂ BỊ KIỂM TRA THUẾ NGAY TỪ 01/07/2026

Luật Quản lý thuế năm 2025 (Luật số 108/2025/QH15) chính thức có hiệu lực từ ngày 01/07/2026 với nhiều thay đổi trong công tác quản lý thuế, tăng cường kỷ cương tài chính và minh bạch hóa nghĩa vụ thuế.  Việc kiểm tra thuế được thực hiện trên cơ sở phân tích, đánh giá rủi ro, cũng như căn cứ vào dấu hiệu vi phạm hoặc yêu cầu quản lý của cơ quan có thẩm quyền. Theo đó, doanh nghiệp có thể thuộc diện kiểm tra thuế trong các trường hợp sau:

(1) Trường hợp hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước hoàn thuế;

(2) Trường hợp hồ sơ thuộc diện kiểm tra sau hoàn thuế đối với hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước theo nguyên tắc quản lý rủi ro trong quản lý thuế và trong thời hạn 05 năm kể từ ngày ban hành quyết định hoàn thuế; 

(3) Trường hợp có dấu hiệu vi phạm pháp luật trong lĩnh vực thuế; 

(4) Trường hợp được lựa chọn theo kế hoạch, chuyên đề; 

(5) Trường hợp theo yêu cầu, đề nghị của cơ quan, người có thẩm quyền; 

(6) Người nộp thuế có rủi ro cao thuộc trường hợp: chia, tách, sáp nhập, hợp nhất, chuyển đổi loại hình doanh nghiệp, phá sản, giải thể, chấm dứt hoạt động, cổ phần hóa, chấm dứt hiệu lực mã số thuế, chuyển địa điểm kinh doanh; 

(7) Trường hợp cơ quan quản lý thuế ban hành quyết định ấn định thuế, xử lý vi phạm hành chính về quản lý thuế hoặc chuyển sang kiểm tra tại trụ sở người nộp thuế;

(8) Trường hợp kiểm tra theo yêu cầu của việc giải quyết khiếu nại, tố cáo về thuế;

(9) Trường hợp hồ sơ miễn thuế, giảm thuế, không thu thuế của người nộp thuế có rủi ro cao;

Ngoài ra, cơ quan hải quan có quyền kiểm tra thuế tại trụ sở người nộp thuế trong các trường hợp nêu trên; kiểm tra sau thông quan thực hiện theo quy định của pháp luật về hải quan; kiểm tra các điều kiện áp dụng chính sách thuế theo quy định của pháp luật có liên quan. Trong quá trình kiểm tra, cơ quan hải quan thực hiện kiểm tra thực tế đối với hàng hóa xuất khẩu, hàng hóa nhập khẩu trong trường hợp cần thiết và còn đủ điều kiện.

Việc kiểm tra thuế này được thực hiện theo hướng quản lý rủi ro, tập trung vào các hồ sơ, giao dịch và người nộp thuế có dấu hiệu rủi ro cao, thay vì kiểm tra đại trà như trước. Điều này đòi hỏi doanh nghiệp phải nâng cao năng lực quản trị tuân thủ thuế và chuẩn hóa hồ sơ ngay từ đầu để giảm thiểu nguy cơ bị lựa chọn kiểm tra.

Khuyến nghị đối với doanh nghiệp:

1. Doanh nghiệp cần chủ động rà soát toàn bộ hồ sơ khai thuế, hồ sơ hoàn thuế, miễn thuế, giảm thuế; đối chiếu dữ liệu hóa đơn điện tử với chứng từ kế toán và báo cáo tài chính; lưu trữ đầy đủ tài liệu chứng minh các khoản doanh thu, chi phí và ưu đãi thuế.

2. Đối với doanh nghiệp đang thực hiện chia, tách, sáp nhập, chuyển đổi loại hình, giải thể hoặc chuyển địa điểm kinh doanh, cần đánh giá trước các rủi ro về thuế và hoàn thành đầy đủ nghĩa vụ kê khai, nộp thuế trước khi thực hiện các thủ tục pháp lý

3. Doanh nghiệp nên thiết lập cơ chế kiểm soát tuân thủ thuế nội bộ, thường xuyên cập nhật các quy định mới và chủ động khai bổ sung khi phát hiện sai sót để giảm thiểu nguy cơ bị xử lý vi phạm và các chi phí phát sinh trong quá trình kiểm tra thuế.